MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 5757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019971	AT	3	6	39	44	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019971	TA	3	6	152	157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019971	GGA	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019971	AG	3	6	228	233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019971	CAAG	2	8	442	449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019971	CAA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019971	AG	3	6	694	699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019971	CAT	2	6	814	819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019971	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019971	ATC	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019971	ATC	2	6	912	917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019971	A	7	7	956	962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019971	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019971	AAT	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019971	A	6	6	1060	1065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019971	T	6	6	1071	1076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019971	TTTA	2	8	1078	1085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019971	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019971	TGAT	2	8	3161	3168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019971	GAT	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019971	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019971	CATT	2	8	3318	3325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019971	T	8	8	3364	3371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019971	TTC	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019971	TTG	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019971	GCT	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019971	ATG	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019971	TCA	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019971	TGA	2	6	5000	5005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019971	TTC	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019971	TC	3	6	5029	5034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019971	TTG	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019971	TC	3	6	5057	5062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019971	CAC	3	9	5067	5075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019971	ATG	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019971	TGA	3	9	5266	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019971	GC	3	6	5369	5374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019971	CCA	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019971	GGC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019971	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019971	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019971	TGAA	2	8	5761	5768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019971	A	7	7	5803	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019971	TGA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019971	TGA	2	6	5917	5922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019971	GT	3	6	6006	6011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019971	GGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019971	TC	3	6	6225	6230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019971	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019971	TGCT	2	8	6362	6369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019971	AT	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019971	TTG	2	6	6430	6435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019971	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019971	ATT	3	9	8401	8409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019971	GCG	2	6	10696	10701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019971	TCC	2	6	10711	10716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019971	AG	3	6	10788	10793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019971	GTT	2	6	11531	11536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019971	A	6	6	11539	11544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019971	T	6	6	11563	11568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019971	TGAAAG	2	12	12795	12806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019971	GCG	2	6	12829	12834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019971	AGG	2	6	12851	12856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019971	GCA	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019971	TGT	2	6	12869	12874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019971	TGT	2	6	12892	12897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019971	AAT	2	6	12967	12972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019971	CTCG	2	8	12979	12986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019971	CGC	2	6	13020	13025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019971	TTA	2	6	16541	16546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019971	TGC	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019971	CAT	2	6	19782	19787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019971	TCTA	2	8	20446	20453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019971	CTA	2	6	20466	20471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019971	ATC	2	6	20472	20477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019971	A	7	7	20483	20489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019971	AGA	2	6	20501	20506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019971	GGC	2	6	21070	21075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019971	CTGTT	2	10	21147	21156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019971	AT	3	6	22887	22892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019971	TATT	2	8	22896	22903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019971	TAG	2	6	22931	22936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019971	GA	3	6	22937	22942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019971	GAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019971	TGT	2	6	24355	24360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019971	GTT	2	6	24383	24388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019971	GCA	2	6	24399	24404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019971	CT	3	6	24442	24447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019971	TTG	2	6	25161	25166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019971	GGAA	2	8	25291	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019971	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019971	GGC	2	6	25470	25475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019971	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019971	GGA	2	6	25617	25622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019971	AAT	2	6	25633	25638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019971	TAAAAA	2	12	26912	26923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019971	T	7	7	26948	26954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019971	TA	4	8	29068	29075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019971	AGAA	2	8	29100	29107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019971	CA	3	6	29124	29129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019971	T	6	6	29194	29199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019971	AAC	2	6	29220	29225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019971	TC	3	6	29422	29427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019971	A	6	6	29460	29465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019971	AAAGCC	2	12	30740	30751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019971	T	6	6	30769	30774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019971	CAG	3	9	30857	30865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019971	ATGA	2	8	31757	31764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019971	A	6	6	31806	31811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019971	TGA	2	6	31816	31821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019971	T	6	6	32848	32853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019971	A	6	6	32960	32965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019971	A	6	6	33345	33350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019971	GAA	2	6	33384	33389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019971	TCAC	2	8	33405	33412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019971	ATG	2	6	33418	33423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019971	TTG	2	6	33429	33434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019971	TGA	2	6	33839	33844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019971	T	6	6	33900	33905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019971	GTC	2	6	33906	33911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019971	TAAT	2	8	33919	33926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019971	CTTT	2	8	34921	34928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019971	TGTT	2	8	36159	36166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019971	GT	3	6	36176	36181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019971	TGA	2	6	36218	36223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019971	TTA	2	6	36226	36231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019971	GA	3	6	36387	36392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019971	TTG	2	6	36400	36405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019971	A	9	9	36416	36424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019971	GT	3	6	36473	36478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019971	AGA	2	6	36486	36491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019971	GTT	2	6	36716	36721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019971	GTT	2	6	36840	36845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019971	GA	3	6	39809	39814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019971	CAC	2	6	39850	39855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019971	GCC	2	6	39937	39942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019971	GTG	2	6	40045	40050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019971	CAGA	2	8	40128	40135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019971	CAG	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019971	GCC	2	6	40222	40227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_019971	CGG	2	6	40360	40365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019971	TAA	2	6	40413	40418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019971	ATG	3	9	40474	40482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019971	ACA	2	6	40518	40523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019971	CTTGT	2	10	42401	42410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019971	GA	3	6	42448	42453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019971	TGT	2	6	42637	42642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019971	T	6	6	42677	42682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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